يتضمن ذلك إزالة جزء أو كل الكلية المصابة. وهذا غالبا ما يكون العلاج الأساسي لسرطان الكلى. هناك نوعان رئيسيان من العمليات الجراحية: استئصال الكلية الجزئي (إزالة الجزء الذي يحتوي على السرطان) واستئصال الكلية الجذري (إزالة الكلية بأكملها). من الممكن العيش بكلية واحدة فقط، حيث يمكن للكلية المتبقية أن تعوض الكلية التي تمت إزالتها. يمكن إجراء الجراحة من خلال الجراحة المفتوحة أو الجراحة بالمنظار (ثقب المفتاح)، حيث توفر الجراحة بالمنظار عادة تعافيًا أسرع.